Відділ інтернатних закладів та інклюзивного навчання
Відділ планування в системі підвищення кваліфікації
Відділ керівних кадрів та координації діяльності метод. кабінетів (центрів)
Відділ виховної роботи і здорового способу життя
Відділ суспільно-гуманітарних дисциплін
Відділ природничо-математичних дисциплін
Відділ дошкільної та початкової освіти
Відділ роботи з обдарованими учнями
Відділ інформаційної та видавничої діяльності
Відділ моніторингу якості освіти, зовнішнього незалежного оцінювання та атестації закладів освіти